Per il resto ho trovato questo

è uno schema della versione b5 suppongo possa essere il tuo modello, ma senza conferme è difficile immaginare qualcosa di più.
Cmq in questo c'è per ogni finestrino un modulo che chiamano PWM power windows module, e come sospettavo è lui a pilotare i motori.
Dove si trovano nell'auto non lo so, se vuoi informazioni specifiche su come affrontare il problema da solo credo sia meglio ti rivolgi al forum dedicato.
http://www.vwgolfclub.it/forum/index.ph ... ettronica/